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将SMILES表达式包裹于<syntaxhighlight lang="text" inline><smiles> </smiles></syntaxhighlight>即可输入有机物的结构式

书写SMILES表达式的规则如下

1. 原子用在方括号内的化学元素表示，如[Ag]: <smiles>[Ag]</smiles>
但B，C，N，O，S，P，F，Cl，Br，I无需方括号。

2. 氢原子会自动补足，无需写明。

3. 在双键部分用“=”，三键部分用“#”，如氰化氢: C#N <smiles>C#N</smiles>

4. 如果结构中有环，则在任意一处开环，并把两边的原子标记同一数字，如环己烷: C1CCCCC1 <smiles>C1CCCCC1</smiles>
注：避免将记号打在多个环公用的原子上

5. 芳香环中的字母需要小写，如苯环: c1ccccc1 <smiles>c1ccccc1</smiles>
芳香环内b，c，n，o，s，p无需方括号

6. 支链用圆括号括起来，如三氟甲烷: C(F)(F)F <smiles>C(F)(F)F</smiles>

7. 双键的同分异构用"/"和"\"表示，如顺二氟乙烯、反二氟乙烯: F/C=C\F、F/C=C/F <smiles>F/C=C\F</smiles> <smiles>F/C=C/F</smiles>

试一试！尝试写出以下物质的SMILES表达式：
<smiles>c1ccc2ccccc2c1</smiles>
<smiles>Cc1c([N+]([O-])=O)cc([N+]([O-])=O)cc1[N+]([O-])=O</smiles>
<smiles>CC#CC(C)(Br)C(C)CC</smiles>
<smiles>F/C(Cl)=C(F)\Cl</smiles>

c1ccc2ccccc2c1（萘）

Cc1c([N+]([O-])=O)cc([N+]([O-])=O)cc1[N+]([O-])=O（三硝基甲苯）

CC#CC(C)(Br)C(C)CC（4,5-二甲基-4-溴-2-庚炔）

F/C(Cl)=C(F)\Cl（最后一个）

若预览中未显示所写结构式，请按以下顺序检查错误：

1. 等待其渲染10s。

2. 检查SMILES表达式是否错误，如CH<sub>2</sub>BrCH<sub>2</sub>Br应写为BrCCBr而非CBrCBr。

3. 检查SMILES表达式是否被<syntaxhighlight lang='text' inline><smiles></smiles></syntaxhighlight>包裹。

4. 检查所有符号均为半角（英文输入法输入）。

5. 检查字母是否打错，如<nowiki><smilrs></nowiki>。

6. 若未解决问题，请向他人求助。